Windows Server 2003有多種版本，每種都適合不同的商業需求：

1. Windows Server 2003 Web版
2. Windows Server 2003標準版
3. Windows Server 2003企業版
4. Windows Server 2003數據中心版
5. Windows Server 2003 Web版

用于構建和存放Web應用程序、網頁和XML Web Services。它主要使用IIS 6.0 Web服務器并提供快速開發和部署使用ASP.NET技術的XML Web services和應用程序。支持雙處理器，最低支持256MB的內存。它最高支持2GB的內存。

Web版的Server不能用來作打印服務器用。

Windows Server 2003標準版

標準的英文名稱：Windows Server 2003 Standard Edition

銷售目標是中小型企業，支持文檔和打印機共享，提供安全的Internet連接，允許集中的應用程序部署。支持4個處理器；最低支持256MB的內存，最高支持4GB的內存。

Windows Server 2003企業版

標準的英文名稱：Windows Server 2003 Enterprise Edition

Windows Server 2003企業版與Windows Server 2003標準版的主要區別在于：Windows Server 2003企業版 支持高性能服務器，并且可以群集服務器，以便處理更大的負荷。通過這些功能實現了可靠性，有助于確保系統即使在出現問題時仍可用。在一個系統或分區中最多支持八個處理器，八節點群集，最高支持32GB的內存（安全模式下為4GB）。

Windows Server 2003數據中心版

標準的英文名稱：Windows 2003 Server Datacenter Edition

針對要求最高級別的可伸縮性、可用性和可靠性的大型企業或國家機構等而設計的。它是最強大的服務器操作系統。分為32位版與64位版：

32位版支持32個處理器，支持8點集群；最低要求128M內存，最高支持512GB的內存。

64位版支持Itanium和Itanium2兩種處理器，支持64個處理器與支持8點集群；最低支持1GB的內存，最高支持512GB的內存。

產品升級

SP1

微軟于2005年3月30日發布了Windows Server 2003的第一個服務包（Service Pack 1）。這個升級為Windows Server 2003用戶提供了很多相似于Windows XP Service Pack 2的功能。這些功能包括：

安全設置向導：此工具讓管理員更方便的更改安全設置。

實時更新（Hot Patching）：此功能使Windows Server 2003在不用重新啟動的情況下安裝DLL，驅動程序，非核心更新。

IIS 6.0數據庫檢查：允許跟蹤數據庫的修改。

Windows防火墻：將Windows XP Service Pack 2里的許多改進加入Windows Server 2003，還包括安全設置向導，它使管理員可以更容易地管理開放的輸入端口，它會自動檢測并選擇缺省角色。

其它網絡方面的改進，包括支持無線供應服務，更好的IPv6支持，以及新的對TCP SYN攻擊的防護。

安裝后安全升級：當Service Pack 1服務器安裝完成后第一次重啟時，一個缺省模式被打開。它設置防火墻阻止所有接入請求，引導用戶去安裝升級軟件包。

數據執行保護（DEP）：支持禁止執行位，有助于防止緩沖區溢出攻擊，它是Windows Server入侵中常用的攻擊手段之一。

Windows媒體播放器，版本10。

Microsoft網站提供了完整的SP1更新項目。

SP2

Windows Server 2003的Service Pack 2已于2007年上半年正式發布。[8]發布日期最初定為2006年上半年。[9]注：微軟未在Windows Service Pack Road Map網站中更新最后修改日期。2006年6月19日，微軟面向Microsoft Connect用戶提供了Service Pack 2的最初測試版，該版本的內部版本號為2721。而最新的內部版本是2725（Beta 1）。微軟將Service Pack 2描述為“標準”服務包而發布，包含先前發布的安全更新、修補程序、及可靠性和性能方面的改進。 除此之外，Service Pack 2包含Microsoft管理控制面板3.0、Windows開發服務（替代遠程安裝服務）、對WPA2的支持與針對IPSec與系統配置實用程序的改進。

Windows Server 2003 R2

R2是Windows Server 2003的改進版本，在2005年12月發售，但舊版的用戶不能免費更新到新版本，而需要付費更新。不過，現時市面上所發售的都是R2。R2的屬性除了包含Win2K3 SP1以外，還有另外一片CD，包含更多新的功能。

R2的額外新功能

1. 分支辦事處服務器管理
2. 文檔和打印機集中管理工具
3. 增強的分布式文件系統（DFS）命名空間管理界面
4. 使用遠程差別壓縮的更有效的廣域網數據復制
5. 身份和權限管理
6. 外網單點登錄和身份聯合
7. 對外網應用訪問的集中式管理
8. 根據活動目錄帳戶信息自動禁止外網訪問
9. 用戶訪問日志
10. 跨平臺的網頁單點登錄和密碼同步，采用網絡信息服務（NIS）
11. 存儲管理
12. 文檔服務器資源管理器 (storage utilization reporting)
13. 增強的配額管理
14. 虛擬服務器
15. 新的版權協議允許最多4個虛擬實例（在企業版及以上版本）
16. 基于UNIX的附加應用實用程序和開發工具，提供了一個相對完整的Unix開發環境。
17. 基本實用程序
18. SVR-5實用程序
19. 基本開發工具
20. GNU開發工具
21. GNU實用程序
22. UNIX Perl
23. Visual Studio Debugger附加程序
24. 綜合打印管理員：對于需要管理大量打印機的企業，新的插件讓管理員可以在一個畫面上同時管理公司內的所有打印機、及各自的貯打印表工作。