據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),全世界癌癥發(fā)病率正以每年3%的速度遞增,全世界每年因癌癥而死亡的人數(shù)已達(dá)600多萬人。癌癥已經(jīng)嚴(yán)重威脅人類生命健康，也成為國際醫(yī)學(xué)界主要的研究和攻克對象。

從醫(yī)學(xué)研究的角度來看，癌癥研究目前主要從藥物研究、致癌機(jī)理、基因?qū)W等不同角度在進(jìn)行。而不論是基因研究還是藥物研究都需要大量的模擬計(jì)算。對人類基因排序?qū)⒊蔀榭茖W(xué)家治愈癌癥的有效手段。歷時數(shù)年、耗資38億美元、迄今為止生物學(xué)領(lǐng)域最大的人類基因工程已經(jīng)使對人類基因進(jìn)行排序成為可能，借助先進(jìn)的技術(shù)手段，科學(xué)家僅需一個月就可以完成一次人類基因排序。

英國癌癥研究所劍橋研究院（CRI）是癌癥研究領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者，擁有450名科學(xué)家和員工，一直致力于癌癥的診斷、治療和預(yù)防方面的研究。科學(xué)家認(rèn)為，弄清楚基因改變的原因有助于了解癌癥的發(fā)展變化以及它對各種藥物的反應(yīng)，為此，CRI近期安裝了新一代的基因序列發(fā)生器以研究基因改變對癌癥的影響。然而這個新的基因序列發(fā)生器每周都產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)，這遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了CRI現(xiàn)有IT系統(tǒng)的處理能力。顯然，要想充分利用這些數(shù)據(jù)的價值，CRI必須升級其IT基礎(chǔ)架構(gòu)以提供更強(qiáng)的處理能力，加速腫瘤研究的進(jìn)程。

CRI評估了多種數(shù)據(jù)處理解決，超級計(jì)算機(jī)因費(fèi)用昂貴直接被排除在考慮范圍之外。該研究所的IT與科學(xué)計(jì)算部門主管Peter Maccallum先生說：“CRI作為慈善機(jī)構(gòu)，必須采用最具成本效益的解決方案。對任何IT部門來說，降低成本都是至關(guān)緊要的，而對CRI來說，這一點(diǎn)更重要，因?yàn)樵贗T系統(tǒng)上節(jié)省的資金越多，投入到核心研究項(xiàng)目上的經(jīng)費(fèi)也就越多。”

在對開源解決方案進(jìn)行評估之后，CRI決定選用Platform Computing公司的高性能計(jì)算(HPC)軟件。Maccallum表示：“開源解決方案很復(fù)雜，安裝所需的時間也很長，不適合我們的需求。而Platform LSF是一個非常好的解決方案，它可以快速部署，并且很便于管理，這是我們采用這個軟件主要原因”。

Platform LSF是Platform為高性能計(jì)算領(lǐng)域推出的集群管理系統(tǒng)，支持異構(gòu)的、分布式的計(jì)算環(huán)境，為用戶提供可靠的集群管理、負(fù)載共享、復(fù)雜的作業(yè)管理及調(diào)度功能和大規(guī)模并行計(jì)算的能力，能幫助用戶最大限度提高關(guān)鍵型任務(wù)環(huán)境的生產(chǎn)效率。CRI在由HP C7000 刀片服務(wù)器和Dell 460刀片服務(wù)器構(gòu)成的高性能計(jì)算集群上安裝部署了Platform LSF。實(shí)際結(jié)果顯示，Platform LSF很好地幫助CRI解決了大型、復(fù)雜作業(yè)的調(diào)度，保證了整個集群的負(fù)載平衡，實(shí)現(xiàn)了以下目標(biāo)：

·用Platform LSF進(jìn)行集群管理，提高了集群的效率，為CRI開辟了新的研究領(lǐng)域，幫助CRI了解癌癥的發(fā)展變化以及其抗藥性。

·僅需很少的支持或者人工干預(yù)就能保證負(fù)載管理系統(tǒng)的正常運(yùn)行，降低了對員工的要求，節(jié)省了人力。

·通過平衡需求和可用的計(jì)算資源，計(jì)算集群管理能夠很好地處理應(yīng)用程序的工作量，這樣CRI的IT系統(tǒng)就能夠輕松處理海量的研究數(shù)據(jù)。

·Platform LSF可以隨著CRI負(fù)載的增加而擴(kuò)展，這使得它能很好地滿足未來研究的需求。

·集群解決方案實(shí)現(xiàn)了資源共享，避免了為各研究小組重復(fù)配置資源，節(jié)省了約50,000英鎊的成本。PlatformLSF是一個工作負(fù)載管理軟件，它以動態(tài)調(diào)配的方式運(yùn)行研究人員的應(yīng)用軟件，它的負(fù)載調(diào)度可充分利用數(shù)據(jù)中心的服務(wù)器集群，這使得CRI的全部21個研究小組都可以共享整個服務(wù)器集群。過去，每一個研究小組都擁有自己的計(jì)算資源，這使得服務(wù)器的成本增加、系統(tǒng)的利用率降低，也增加了維護(hù)費(fèi)用和復(fù)雜性。采用共享服務(wù)器的方式后，節(jié)省了重復(fù)購買硬件和維護(hù)的費(fèi)用，降低了維護(hù)經(jīng)費(fèi)和繁雜性。

·Platform LSF的調(diào)度方案通過保證研究小組或研究工作的資源量，確保機(jī)構(gòu)達(dá)到服務(wù)水平協(xié)議。它的公平分享政策可以使每個小組和用戶得到公平的資源分享，在指定時間內(nèi)確保他們得到研究中所需的計(jì)算能力。

“Platform LSF帶來的最大好處是幫助我們開拓了新的研究領(lǐng)域。現(xiàn)在我們有很好的方法來產(chǎn)生和管理龐大的基因序列數(shù)據(jù)，這在以前是完全不可想象的。借助Platform LSF軟件，我們已經(jīng)在乳腺癌研究方面取得了顯著的進(jìn)展，同時，我們的研究人員也可以更好地認(rèn)識癌癥的發(fā)展過程。” Maccallum先生說。為了加強(qiáng)利用高性能集群來處理大數(shù)據(jù)集方面的合作，目前CRI正在與Platform Computing合作，建立跨組織機(jī)構(gòu)間的集群系統(tǒng)。未來，CRI還計(jì)劃擴(kuò)展Platform LSF，以根據(jù)研究工作對計(jì)算能力的需求增添更多的服務(wù)器。