華為云CCI全方位支撐基因檢測核心技術
中國每年有1400萬新生兒、300萬新發腫瘤患者。意味著每5個家庭迎來新添成員的喜悅,就有一個家庭陷入可能失去親人的悲痛。每一天,都有8000+人失去健康。
如果可以早知道、早預防、早治療; 如果我們有一份報告,告訴我們可能在自己身上發生的病變;如果我們可以趕在時間前面、趕在疾病前面。。。。這聽起來是不是有點科幻?
2017年,我國發改委明確了基因檢測能力覆蓋50%以上出生人口的目標,利用基因測序等高科技手段,在胎兒罕見病篩查、腫瘤、遺傳性疾病等方面實現精準的預防和診治。通過對血液、體液、細胞或DNA通過基因測序等技術手段進行檢測,分析是否含有潛在高風險疾病可能性,以及表達功能是否正常。
更多的疾病將依賴基因檢測結果作為主要信息作出診療判斷,基因檢測技術也為精準治療藥物的創新開發,減少無效和過度醫療、避免有害醫療、遏制醫療費用過度支出等提供大數據平臺支撐。
在基因檢測技術中,工具碎片化、開發語言多樣、系統維護和升級等技術難題一直在制約行業的快速發展。容器技術因為標準化封裝保證環境一致性、秒級擴縮容、高資源利用率的特點逐漸作為支撐基因檢測的核心技術。
在這一場推動人類繁榮發展的浪潮中,上海其明信息技術有限公司就是其中之一,通過先進的云計算技術為醫療用戶提供更高效診斷,更科學化的建議,所開發的基因檢測與基因云計算的GCBI綜合平臺被廣大醫療及科研院所接受。華為云容器實例(Cloud Container Instance)服務(以下簡稱華為云CCI),以高安全、高性能、低成本、簡單易用的優點作為GCBI的底層核心技術支撐,幫助GCBI平臺服務于基因檢測行業。
基因檢測挑戰諸多 華為云CCI多方位承載GCBI核心業務
華為云CCI在2018年3月推出公測,也是全球***基于K8S的商用serverless容器服務,在多方面滿足了其明公司的需要:
華為云CCI目前采用Kata安全容器技術,將虛擬機成熟的隔離技術應用到容器領域,確保客戶業務和數據的安全。
1. 按需按秒計費很有必要,節省成本可達50%
基因測序公司在承接用戶業務時,通常是在樣品累積夠一定量的時候進行批量處理,這就意味著原始數據來源具有周期性,業務波動性較大。為了保證對醫療及科研客戶的交付,其明公司通常是按照***的業務量來維護虛機規模,但是這些資源在相當一段時間內處于閑置狀態,造成極大的浪費。
華為云CCI按需按秒計費的功能妥善的解決了這一難題,解決了其明公司業務波動性帶來的資源浪費以及成本難問題。經過上海其明公司信息技術有限公司仔細測算,按需按秒計費比包年包月節省成本高達50%。
2. 從20分鐘提升為秒級并發,華為云CCI功不可沒
在基因測序的市場中,幾乎所有的公司都會面臨這樣的問題:基因測序以及測序結果的解析需要較長時間,用戶無法實時拿到實驗結果,便會產生不信任的心理,會對新事物產生質疑
其明公司也不例外,每個樣品需要8核至32核容器實例進行計算,后臺需要高并發的計算量在兩小時內反饋結果,以保證其對客戶的SLA。然而每次啟動虛機,集群和節點納管、業務上線時間就需要近20分鐘,即使是業務擴容,也需要耗費10多分鐘。
華為云CCI秒級伸縮和高并發的特性針對這一問題做出了極大改善,kata容器啟動速度實測600毫秒,集群規模高達上十萬容器實例,其明公司GCBI平臺在使用華為云CCI服務后,業務上線時間從20分鐘降為秒級并發,大大提升效率,不會再為滿足客戶SLA感到擔心。
3. 運維簡化后,省心省力省錢,只需專注業務。
在使用華為云CCI之前,其明公司在自己的公有云虛機資源內納管了一個小型的K8S集群,并積累了大量的實戰經驗,即便如此,對硬件資源和K8S集群的運維依然是件頭疼的事,需要考慮集群的升級、社區bug修復、集群資源利用率等問題,消耗著公司大量資源。
華為云CCI將serverless理念引入到容器領域,可以直接購買和管理容器實例,無需管理物理資源和K8S集群,同時,華為云CCI提供了可視化的pod CPU/MEM監控功能,可以實時監控處理過程,極大的簡化運維成本,讓上海其明公司信息技術有限公司可以專注自己的業務。
其明公司開發總監蔡家華表示:“通過將自己的業務部署在華為云CCI上,實際計算成本降低30%-50%,并且實現了K8S和物理資源免運維。其明公司非常高興華為云CCI可以幫助自己實現一系列成本的降低,提升客戶SLA的服務標準,讓自己可以更聚焦業務和客戶。”
有華為云助力,其明公司基因檢測與基因云計算的綜合平臺GCBI已完成25萬例基因數據分析和挖掘、協助作出1萬多次基于基因信息的臨床決策,參與8萬余個疾病相關基因臨床信息挖掘研究項目。
人工智能也好,基因檢測也罷,好的技術應該用來幫助更多的人。將至已至,未來已來,3月21日,華為中國生態伙伴大會,我們并肩同行,福州見。