華西醫院、華為、賽樂基因聯合發布“多組學數據加速分析平臺”
9月28日,在“四川大學125周年校慶活動暨第七屆生物醫學大數據·智能技術應用峰會”開幕式上,四川大學華西醫院、華為技術有限公司、賽樂基因科技(北京)有限公司聯合發布多組學數據加速分析平臺,該平臺基于GPU加速,集數據存儲、計算、管理、使用為一體,旨在推動基因測序技術創新,加速醫療行業數字化轉型。
華西醫院、華為、賽樂基因聯合發布“多組學數據加速分析平臺”
目前,基于該平臺已經取得重大階段性進展:30X人類WGS胚系變異分析時間從24小時縮短至7分鐘,這是全球首次將人類全基因組分析推進至分鐘級時代,在多組學數據分析領域具有跨時代的意義。
隨著新一代基因測序技術(Next Generation Sequencing,NGS)和測序儀的發展,基因測序速度不斷提升,測序成本不斷下降,人類全基因組的測序成本從過去的30億美金已經下降到500美金,由此帶來了基因相關科學研究和應用的快速發展,目前基因測序技術已經在生育健康、腫瘤個體化診斷和治療、遺傳病、傳染病檢測、疫苗研發等領域獲得廣泛的應用,為精準醫療和個性化醫療帶來眾多革命性創新。
與基因行業的快速爆發相對應,基因測序數據則呈現指數級增長趨勢,未來有可能比肩天文數據量。當前每臺最先進的基因測序儀每天產生的測序數據已經達到6TB,每年產生的數據則高達數十PB,且需要永久保存。為了及時分析這些海量的基因數據,測序企業和科研機構往往需要投入高額資金建設高性能計算集群和數據中心。因此,基因數據的分析速度與成本日益成為掣肘基因測序行業發展的關鍵因素。如何提升基因數據的分析效率、降低成本投入成為業內公認必須解決的新課題。
此次三方創新合作,充分發揮了華西醫院在多模態組學數據分析和基因應用等領域的領先學術和產業優勢,華為公司在高性能數據存儲和先進基因數據管理系統上的技術積累,以及賽樂基因在GPU加速生物信息數據分析領域的行業經驗。面向未來,三方的創新合作有望在基因測序領域,以數據為驅動,以創新為引擎,加速數據與存儲技術賦能生物科技產業,促進甚至引領醫療行業的數字化變革。
華西醫院數據科學家于浩澎博士發表演講
“多組學大數據時代已經到來,華西醫院多組學數據加速分析平臺創新性地引入華為OceanStor Pacific面向多樣化算力的融合分析數據底座,以及賽樂基因BaseNumber基因數據分析GPU加速方案,推動多組學數據分析邁入分鐘級時代。”華西醫院數據科學家于浩澎博士在下午的演講中提到,“此項研究成果的發布,將加速精準醫療大數據在醫學上的廣泛應用。”
華西醫院作為醫學科研機構的龍頭,深刻理解醫療行業業務需求,賽樂基因在基因數據分析技術領域深耕多年,華為公司則能提供最好的數據基礎設施平臺。此次ICT技術與生命科學的融合創新,將加速智慧醫療產業發展,為未來的基因科學做出貢獻,促進人類的健康福祉。